گفتگوی مخفی نیز سرانجام در طی به روز رسانی های متعدد تلگرام به این پیام رسان اضافه شد. گفتگوی مخفی از روش رمز نگاری دو طرفه یا end-to-end encryption استفاده می کند و به گفته ی سران تلگرام هیچ اطلاعاتی از گفتگوهای مخفی روی سرور تلگرام ذخیره نمی شود.
این قابلیت از Self-Destruct نیز پشتیبانی می کند. این بدان معناست که پیام های مخفی بعد از مدت زمان معینی به طور خودکار نابود می شوند و اثری از آن ها باقی نمی ماند. همچنین در گفتگوی مخفی فوروارد پیام برای کاربران دیگر و ثبت اسکرین شات امکان پذیر نیست.
تلگرام ادعا می کند که فایل های چند رسانه ای نیز رمزنگاری شده و پس از آن برای فرد مورد نظر ارسال می شوند. برای شروع یک گفتگوی مخفی از منوی کشویی (عکس پایین) گزینه New Secret Chat را انتخاب کنید.
با اشاره روی این گزینه، به لیست مخاطبین منتقل خواهید شد و باید فردی را برای شروع گفتگوی مخفی انتخاب کنید. پس از آن منتظر بمانید تا شخص مورد نظر به گفتگوی مخفی با شما بپیوندد.
برای مشخص کردن زمان نابود شدن پیام ها قسمت بالایی صفحه (جایی که تصویر شخص مقابل قرار دارد) را لمس نمایید. سپس گزینه ی Self-Destruct Timer را انتخاب و مقادیر آن را به دلخواه تغییر دهید.